Table 3 Candidate genes in SAH identified by SKAT-O analysis
From: Exome sequencing study revealed novel susceptibility loci in subarachnoid hemorrhage (SAH)
Gene | P value | Number of Marker All | Number of Marker Test | MAC | m | Method bin | MAP |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
OBSCN | 0.005 | 37 | 36 | 40 | 37 | ER.A | −1.000 |
ABCG8 | 0.010 | 8 | 7 | 7 | 7 | ER | 0.003 |
PIGG | 0.010 | 9 | 7 | 7 | 7 | ER | 0.003 |
GOLGA2 | 0.021 | 6 | 6 | 6 | 6 | ER | 0.007 |
MTMR4 | 0.021 | 7 | 7 | 7 | 6 | ER | 0.007 |
MYH1 | 0.021 | 6 | 6 | 6 | 6 | ER | 0.007 |
TCF3 | 0.021 | 6 | 6 | 6 | 6 | ER | 0.007 |
KMT2C | 0.026 | 9 | 9 | 9 | 9 | ER | 0.001 |
FBN3 | 0.039 | 13 | 12 | 12 | 11 | ER | 0.000 |
ABCG5 | 0.044 | 5 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
BCL9 | 0.044 | 5 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
C1orf94 | 0.044 | 5 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
CCDC102A | 0.044 | 7 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
CEBPZ | 0.044 | 5 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
COG3 | 0.044 | 4 | 4 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
CTC1 | 0.044 | 5 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
FDXR | 0.044 | 5 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
GRIK3 | 0.044 | 5 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
INCENP | 0.044 | 3 | 3 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
IQGAP3 | 0.044 | 6 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
KNDC1 | 0.044 | 5 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
LETMD1 | 0.044 | 4 | 4 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
METTL22 | 0.044 | 4 | 4 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
NCOA6 | 0.044 | 5 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
OTOGL | 0.044 | 5 | 4 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
PDZD7 | 0.044 | 3 | 3 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
PIF1 | 0.044 | 6 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
PLXNA4 | 0.044 | 4 | 4 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
RAPGEFL1 | 0.044 | 3 | 3 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
RGS14 | 0.044 | 4 | 4 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
SCN7A | 0.044 | 5 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
THEG | 0.044 | 5 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
VEPH1 | 0.044 | 5 | 5 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
ZFP90 | 0.044 | 4 | 4 | 5 | 5 | ER | 0.014 |
LENG8 | 0.050 | 8 | 8 | 8 | 8 | ER | 0.002 |
NIPBL | 0.050 | 8 | 8 | 8 | 8 | ER | 0.002 |
TECPR2 | 0.050 | 9 | 8 | 8 | 8 | ER | 0.002 |